2006年全国财政收入预计为35423.38亿元，同比增长12%，财政支出38373.38亿元，增长13.8%。其中，中央财政安排用于“三农”的支出将达3397亿元，比2005年增加422亿元，占中央财政总支出增量的21.4%。
　　根据财政部向十届全国人大四次会议提交的《关于2005年中央和地方预算执行情况与2006年中央和地方预算草案的报告》，2006年财政赤字和国债资金将“双降”，财政赤字2950亿元，比2005年预算减少50亿元，财政赤字占GDP的比重预计进一步下降到1.5%；安排国债项目资金600亿元，比2005年减少200亿元。
　　预算草案中显示，2006年中央财政总收入19272.04亿元，比2005年增加2022.25亿元，增长11.7%；中央财政总支出22222.04亿元，比上年增加1972.63亿元，增长9.7%。中央财政国债余额35568亿元，增加2954亿元。
　　在中央财政支出的具体项目上，将安排中央财政预算内基建投资总规模1154亿元，与2005年一致；出口退税指标4264亿元；“三农”支出3397亿元；安排社会保障补助支出和就业再就业支出1859.82亿元，比2005年增加236.23亿元，增长14.5%；科技支出716.04亿元，增长19.2%；国防支出2807.29亿元，增长14.7%。
　　加快建设社会主义新农村方面，中央将着力加大政策扶持和资金投入力度。2006年将在全国范围内取消农业税，积极研究提出烟叶特产税替代方案，实施国有农场税费改革；安排粮食直补资金125亿元，良种补贴资金40.7亿元，农机具补贴资金6亿元；新型农村合作医疗试点范围将推广到40%的县，财政补助标准也将由10元提高到20元。
　　报告中还提出，2006年将逐步将国有资产有偿使用收入、国有资本经营收益、特许经营收入、罚没收入、捐赠收入纳入非税收入管理范围。